May 27th, 2010 / 1 Comment » / by bioXmed
Software for Image Analysis
Voxx : Written by Jeff Clendenon and Jason Byars
A voxel-based (not surface-based) 3D imaging program capable of near real-time rendering of large microscopy data sets on inexpensive personal computers has been developed in the Indiana Center for Biological Microscopy. It was designed to use the low-cost (NVIDIA GeForce) 3D graphics processors found on video boards in many lab and office PCs, instead of the more expensive voxel processors or graphics workstations commonly used by others for voxel-based rendering. The program currently runs on Windows 98/NT/2000, with Apple MacOS and Linux ports underway.
Confocal Assistant (ver 4.02): Written by Todd Clark Brelje
A very neat and powerful program that reads Bio-Rad PIC images. It allows users to make format conversion, projection, movies, color encoding, montages, etc. Those who use Metamorph (Universal Imaging) will still find Confocal Assistant useful. It is a lot faster than Metamorph when you make projections. Best of all, it’s free!
ImageJ : From the NIH
A free image processing tool from the NIH. It has an extesive library of plugins.
Zeiss LSM offline browser R3.5: From Carl Zeiss, Inc.
You need it to convert your LSM images to Tiff format. If you have problem installing and have DAO related error messages, you may need the dao.zip fil
LCSlite：From Leica
ImageTool
Confocal Assistant
Version 4.02
An amazing little program written by Todd Clark Brelje for reviewing and manipulating BioRad .pic image stacks
Zeiss LSM Image Examiner
Version 3.5
From Carl Zeiss, Inc. You will need it for browsing your Zeiss libraries away from the microscope.
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May 25th, 2010 / No Comments » / by bioXmed
DOS和Windows最大的不同在于DOS命令方式操作，所以使用者需要记住大量命令及其格式使用方法，DOS命令分为内部命令和外部命令，内部命令是随每次启动的COMMAND.COM装入并常驻内存，而外部命令是一条单独的可执行文件。在操作时要记住的是，内部命令在任何时候都可以使用，而外部命令需要保证命令文件在当前的目录中，或在Autoexec.bat文件已经被加载了路径。
常用的内部命令
DOS的内部命令是DOS操作的基础，下面就来介绍一些常用的DOS内部命令。
1、DIR
含义：显示指定路径上所有文件或目录的信息
格式：DIR [盘符：][路径][文件名] [参数]
参数：
/W：宽屏显示，一排显示5个文件名，而不会显示修改时间，文件大小等信息；
/P：分页显示，当屏幕无法将信息完全显示时，可使用其进行分页显示；
/A：显示具有特殊属性的文件；
/S：显示当前目录及其子目录下所有的文件。
举例：DIR /P
将分屏显示当前目录下文件。在当前屏最后有一个“Press any key to continue . . .”提示，表示按任意键继续。
2、CD
含义：进入指定目录
格式：CD [路径]
举例：CD DOS
CD命令只能进入当前盘符中的目录，其中“CD\”为返回到根目录，“CD..”为返回到上一层目录。
3、MD
含义：建立目录
格式：MD [盘符][路径]
举例：MD TEMP
表示在当前盘符下建立一个名为TEMP的目录。
4、RD
含义：删除目录
格式：RD [盘符][路径]
举例：RD TEMP
表示删除当前路径下的TEMP目录，需要注意的是，此命令只能删除空目录。
5、COPY
含义：拷贝文件
格式：COPY [源目录或文件] [目的目录或文件]
举例1：COPY C:\*.COM D:\”，表示将C盘根目录下所有扩展名为COM的文件拷贝到D盘根目录中。
举例2：COPY C:\autoexec.bat C:\autoexec.bak
表示将autoexec.bat文件复制成为扩展名为BAK的文件。输入DIR命令，可以发现此变化。
6、DEL
含义：删除文件
格式：DEL [盘符][路径][文件名] [参数]
举例：DEL C:\ *.BAK /P
表示删除当前目录下所有扩展名为BAK的文件，参数/P表示可以使用户在删除多个文件时对每个文件都显示删除询问。
7、SYS
含义：传递系统文件命令。
格式：SYS [源盘符][目的盘符]
举例：SYS C: A:
此命令将为A盘传送系统，传送成功后，A盘将成为系统启动盘。
常用的外部命令
DOS的外部命令就是一些应用程序，这些外部命令都是以文件的形式存在，Windows系统的DOS外部命令保存在Windows主目录下的Command目录中。下面来介绍几个常用的DOS外部命令。
1、EDIT
含义：简单的编辑软件，可以用它来编辑一些程序和批处理文件。
格式：EDIT [盘符][文件名]
举例：EDIT C:\Autoexec.bat
输入此命令后将打开编辑器。在编辑状态下输入文件内容后，按Alt+F键激活File菜单，按向下的箭头选择退出(Exit)，提示是否要保存刚才输入的内容，如果要保存，只需输入Y或者直接回车即可。
2、FORMAT
含义：格式化命令，可以完成对软盘和硬盘的格式化操作。
格式：FORMAT [盘符] [参数]
举例：FORMAT A: /S/Q
此命令将格式化A盘，其中参数/Q表示进行快速格式化，/S表示完成格式化后将系统引导文件拷贝到该磁盘，这样软件就可以作为DOS系统启动盘了。格式化过程中，屏幕上会显示已经完成的百分比。格式化完成后，会提示为磁盘起一个名字，最后还会报告磁盘的总空间和可利用空间等。
3、XCOPY
含义：拷贝命令
格式：XCOPY [源路径][源目录/文件名] [目的目录/文件名] [参数]
举例：XCOPY C:\ABC D:\ /s
执行此命令后，将把C:\ABC目录及其目录中的文件全部拷贝到D盘根目录下，XCOPY是COPY的增强命令，可以实现对多个子目录进行拷贝。最常用的参数是/S，它可以对一个目录下的所有子目录进行拷贝。
4、DELTREE
含义：删除目录树
格式：DELTREE [盘符][路径]
举例：DELTREE ARE
表示删除当前路径下的ARE子目录，执行后会提示是否确认删除，按下Y，即可删除。
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Tags: DOC
May 25th, 2010 / 1 Comment » / by bioXmed
Dynamic PET/CT imaging of BALB/C mouse injected with 18F-CLIO. Fused PET/CT coronal images at 2 h (A), 7 h (B), and 16 h (C) postinjection of 18F-CLIO. PET only coronal images at 2 h (D), 7 h (E), and 16 h (F) postinjection of 18F-CLIO. CT only coronal image (G). Three-dimensional rendering of fused PET-CT images at 2 h (H) and 16 h (I) postinjection. Arrow (green) indicates blood pool region of interest (ROI) and asterisk indicates liver ROI.
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May 24th, 2010 / No Comments » / by bioXmed
英语口语：向老外宣传自己必需
英语写作：发paper必需
英语阅读：文献调研必需
查全文献的能力：文献调研必需
Idea：这个是要靠缘分的
做PPT的能力：宣传自己成果必需
表演的能力：宣传自己成果必需
最重要的是passion
呃……我总结了一下，作为一个科研工作者，最起码要满足的条件我都没有满足。崩溃，以上几条，将是我以后工作的奋斗目标。
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May 20th, 2010 / No Comments » / by bioXmed
首先，很稳定。
其次，整个控制面板都很人性化。无限制，无广告。
最后，DNS尚未被GFW屏蔽，打开速度迅速。
唯一的问题：每月点击一次，or登陆一次？这个问题还没研究明白。
目前，用的很开心：）
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Tags: 免费虚拟主机
May 20th, 2010 / 1 Comment » / by bioXmed
即毕业论文发表后，其中内容无法再申请专利。
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依 据《中华人民共和国专利法》、《中华人民共和国专利法实施细则》以及国家知识产权局发布的《专利审查指南》，如果一项发明创造的实质性内容在申请日以前被国内外出版物公开，则就该发明创造的专利申请将不具备新颖性，因此不能被授予专利权。
第二十四条申请专利的发明创造在申请日以前六个月内，有下列情形之一的，不丧失新颖性：
(一)在中国政府主办或者承认的国际展览会上首次展出的;
(二)在规定的学术会议或者技术会议上首次发表的; 专利法实施细则的规定，是指国务院有关主管部门或者全国性学术团体组织召开的学术会议或者技术会议。
(三)他人未经申请人同意而泄露其内容的。
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Tags: patent
